Дитяча поліклініка має велику історію. У 1946 році була організована дитяча консультація, в якій працювало три лікаря і три медсестри. З 1955 року дитяча консультація перейменовується  в дитячу поліклініку і штат розширюється до 5 педіатрів. З 3.12.2018 року лікарня реєструється у державному реєстрі як комунальне некомерційне підприємство Конотопської міської ради "Конотопська міська лікарня". Поліклініка тепер має назву КНП КМР "Конотопська міська лікарня", дитяча поліклініка. 

Місцезнаходження поліклініки зручно для відвідувань: вона знаходиться в районі залізничного та автовокзалу, поруч проходять трамвайні колії і маршрути міського автотранспорту. Дитяча поліклініка розташована на території самої лікарні, що є позитивним моментом, оскільки всі відділення знаходяться поруч.
   Надання медичної допомоги дитячому населенню дитячої поліклініки надається лікарями даної поліклініки від народження і до того моменту, коли їм виповниться 18 років. Діти, яким виповнилося 18 років, передаються у поліклініку по обслуговуванню дорослого населення і спостерігаються там. Поліклініка має в наявності кабінет щеплень та процедурний кабінети, бокс, інфекційний кабінет. На цей час в поліклініці працює дружній колектив, що складається з 7 педіатрів, 3 фахівців. Розрахована поліклініка на 200 відвідувань в зміну.